聪明活泼的逗逗、迪迪希望能够成为帮助村民解决各种问题的酷比侦探。爷爷告诉他们：要成为真正的酷比侦探，必须通过重重考验，集齐100枚酷比徽章。他们接到村民们的求救：甜甜无故失踪、考拉的蛋糕被偷、阳光森林出现怪物。为了帮助村民，他们勇敢地开始了一系列充满冒险、趣味十足的“侦探之旅”。通过细心观察、层层推理，他们最终为村民们解决了一个又一个的难题，如愿获得酷比徽章。
十年前，风暴的父亲在战斗中被入侵地球的狂岚博士抓走，风暴的家乡蓝虎村也一同消失。如今，风暴已经成为了宇宙护卫队的队长，并偶然得知父亲风雷和狂岚博士可能被困在异时空--某颗位于平行宇宙的星球。于是风暴和伙伴们通过制造时空缝隙来到异时空，并找到了消失的蓝虎族。原来狂岚博士十年前造成的能量波动意外把自己和蓝虎村传送到 了异时空。狂龙博士囚禁了很多蓝虎村民用于做实验，其中包括风暴的父亲风雷。风暴救出了已被折磨到失忆的父亲，没想到在打开时空裂缝返回地球时，狂岚博士也得以一同返回地球，并率领自己的火恐龙兽军团再次试图占领地球。危难之时，风暴唤醒了失忆的风雷，父子合力带领护卫队其他成员战胜了狂岚博士和火恐龙兽军团，保护了地球安全。
马天与邪恶李博士合作，企图发明可怕传染病毒和疫苗来大赚黑心钱，未料在一次运输意外中将未成熟的病毒扩散在城市里，此阶段的病毒会选择有犯罪基因的人做为宿主，并变异人类基因成为暴恶兽人-欧克瑟。另一方面，科学家柯国龙利用大自然的四元素（火、水、气、土）能量，发明了四套超级铠甲（火焰铠甲拿瓦、海啸铠甲茨纳米、旋风铠甲驭拏多、晶钢铠甲酷雷伏），只有自然的四元素能量能消灭反自然病毒的黒能量。随着对欲望的走火入魔以及对暴恶兽人欧克瑟研究的进展，马天有了建立欧克瑟世界的疯狂念头；所幸，以端木燕为首的一群热血青年开始介入欧克瑟案件，成功阻止马天的计划。端木燕、马阔海、萧风、柯胜、马灵灵等青年一方面以科学推理的侦探精神协助警方将欧克瑟案件侦破，另一方面即利用超级铠甲的自然能量给予违反自然的可怕欧克瑟迎头痛击。
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在全宇宙可以自由通航的未来，在木星举办的竞技真人秀风暴法米拉大赛风靡太阳系，而这一届的冠军之争将在麦当与极光之间展开。
