剧集分为八个单元故事，讲述马德钟所演的非常检控观带领一众团队，透过非一般的手法，为受害人寻求公义，带出非常检控观念。
阿安（马浚伟 饰）父亲早逝，10多岁就到街坊金老板（郑则仕 饰）的金石记去当学徒学石碑雕刻，养家糊口。一晃数年过去，安boy早已成为出色的石雕师傅，金老板亦十分照顾他，当他亲生儿子一样看待。金老板的儿子阿Roy（曹永廉 饰）为人好高骛远，大学毕业进入了大公司任职。阿Roy善于经营，炒股赚了大钱，一时意气风发，但随后股市低迷反而亏了很多。街坊嘉嘉（钟嘉欣 饰）和男友G-man 经营的手机店为了赚钱进了一批假电池，阿安不知情买回来后假电爆炸去找他们理论反而遭到恶言相向。随后嘉嘉看清男友G-man本质，和他分手了，并在阿安的鼓励重新开始自己的人生。而金老板决定退休，面对方旺记的高价收购，金老板思考再三决定还是将金石记便宜转让给阿安，为的就是要保住金石记这一块金漆招牌。阿安接手金石记后，生意更加红火，他的人生正在展开一段金石良缘。
香港SARS疫潮过后，人们终于从阴霾中走出来。脑外科医生程至美（吴启华饰）突然得知前女友的死讯，情绪崩溃，极度自责抑郁。法医岑雅晴（黎姿饰）伴其左右，鼓励他重新建立信心。急症室医生黎国柱（林保怡饰）结束了与女友的恋情，却卷入与骨科医生叶淘（吴美珩饰）及见习医生曾淑淇（廖碧儿饰）的三角恋中。不幸感染SARS的心脏科医生林敏智（陈豪饰）留下后遗症，为保全名声而隐瞒病情，却令病情日益恶化。妇产科医生万安生（邵美琪饰）与急症科医生向众仁（曹永廉饰）正计划共同生活，然而却因护士戴玉莹（姚嘉妮饰）的介入而面临一场情感考验。由香港无线电视制作的现代时装医务纪实电视剧《妙手仁心3》是《妙手仁心》系列的第三辑，监制戚其义与编剧周旭明的黄金组合更是精心打造此辑“妙手系列”。此辑剧集在风格上延续了前两辑经典之处，一如既往的得到医务人员协助实景拍摄，继续讲述医护人员在工作中的点滴故事。
22年前，于澳门街内，朱莎娇是夜总会的台柱，与港大学生祝展辉发生了一段情并怀了身孕，展辉却要远赴纽约修读新闻系。因此，莎娇便独自一人诞下女儿祝君好。莎娇的歌坛姐妹文贵芳因受不住司警男友遗弃的打击，以腐蚀性液体灌害她的儿子文初，幸莎娇及时救回其性命，但文初却从此变成哑巴。莎娇收养了文初并抚养成人。22年后，君好与文初长大成人，展辉的爱徒司徒礼信在一次机缘巧合下，与君好及文初成了好友，并想尽办法医好文初的病。文初再遇生母芳，并用自己的储蓄为芳还债。此时，文初与礼信都发现自己爱上君好，文初为了君好的幸福而退出这段
新興毒品「粉精靈」流竄市面，臥底潘奕風（馬貫東 飾）潛伏多年，終令真正製毒師一權世豪（杜燕歌 飾）被拘捕。但世豪金蟬脫殼獲得輕判！奕風為提防世豪出獄後會讓「粉精靈」再度肆虐，請求上司批准他組織臥底小組，調查向世豪提供原材料的上線，圖能將整條黑暗製毒鍊連根拔起。奕風找來三名各擅勝場的臥底嬌娃一「女版福爾摩斯」沈佳琪（張曦雯 飾）、「細心敏銳武術通」江妙姿（陳瀅 飾）、「百孌行走數據庫」童小茹（羅毓儀飾），以美貌設陷阱、以感性作利刃、以智慧當盔甲，接近目標人物一表面上是慈善商家劉彪（關禮傑 飾）和卡邦妮（邵美琪 飾）夫婦，及其背後的四聯商會。四聯商會勢力龐大，滴水不漏，唯一突破點便是劉氏夫婦的女兒劉寶儀（鍾柔美 飾）。奕風此次任務雖然獲得直屬上司禤步青（黃子雄 飾）鼎力支持，卻被鄰組警司郭宗南（黃子恆 飾）懷疑他在任臥底期間，早已變節。奕風挺著腹背受.
