Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。（有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
「……原来我，可以活着呀。」明明能力值为零，却被选进勇者小队的芙兰姆。唯一拥有的是种名为「翻转」的莫名能力。果不其然，虽在战斗中完全派不上用场，仍不气馁努力为小队奉献。然而队中一位赫赫有名的天才贤者吉恩却看她不顺眼，不只动不动就找碴，最后甚至硬是把她卖给了奴隶商人。在奴隶商会内受尽折磨的芙兰姆，某天为了娱乐目的，即将沦为怪物的大餐。没想到，当她举起号称一拿到手就会将身体融化的「诅咒大剑」瞬间——她的人生急遽翻转。
利物飞德两大名校分别有着这样两个超人气校草男团，然而在一个身份成谜的女孩转学过来之后，可怕的事件接连不断...吸血鬼少年与狼少年都认定是对方所为，随时警戒着彼此。但与此同时，却又不断陷入转学生秀荷的强烈吸引力无法自拔。前世延续至今的命运将少年与少女绑在了一起，随着真相慢慢被揭开，他们的世界开始发生天翻地覆的变化...“等你相信我是真的相信你的时候，等你也相信你自己的时候，一定要咬我哦。”少年们因羁绊而不断发现与成长的故事就此拉开序幕。
